Sebagai respon terhadap perkembangan ilmu pengetahuan khususnya dalam bidang teologi dan Pendidikan Agama Kristen, maka STT Intheos Surakarta mengembangkan banyak penelitian maupun kajian ilmiah terutama yang bernafaskan Injili-Pentakosta. Penelitian dan kajian ilmiah tersebut berupa kajian biblika maupun penelitian lapangan terhadap suatu isu teologis maupun isu yang sedang berkembang di masyarakat secara umum.

Hasil dari penelitian maupun kajian ilmiah tersebut kemudian dipublikasikan melalui jurnal yang diterbitkan oleh STT Intheos Surakarta. Selain itu beberapa dosen juga aktif menebitkan buku yang memuat hasil pemikiran dan kajiannya terhadap suatu bidang.